後藤 佑樹Yuki Goto

准教授


出身地
神戸市
好きなこと・もの
新商品のチェック(特にラムネとチロルチョコ)
好きな場所
とにかく高い所。緑道沿いの遊歩道、大文字山
もし大型連休がとれたら?
オーロラ観察、南米アマゾンの滝巡り、アルプスの氷河制覇
これだけは誰にも負けないぞ!
「ムチャ」をするための精神年齢
研究がクライマックス時の脳内テーマソング
TRUTH, God Only Knows
菅研究室に入って良い意味でびっくりしたこと
ネタ・出し物にかける情熱と時間のハンパなさ。
研究へのモチベーションの源は?
自分が思う通りの結果が出た時の「ヨッシャ!」です。
未来の後輩にメッセージ
日々「楽しむ」ことを忘れず、一緒に成長していきましょう!!
科学とは○○である
自然界に対する挑戦

学歴・職歴

2003年3月:
京都大学工学部工業化学科 卒業(齋藤烈教授)
2005年3月:
京都大学大学院工学研究科合成・生物化学専攻 修士課程 修了
(中谷和彦助教授)
2008年3月:
東京大学大学院工学系研究科先端学際工学専攻 博士課程修了 博士(工学)
(2006年4月〜2008年3月:日本学術振興会 特別研究員)(菅裕明教授)
2008年4月:
イリノイ大学アーバナ・シャンペーン校 Postdoctoral research associate
(2008年4月〜2009年9月:日本学術振興会 海外特別研究員)
(Wilfred A. van der Donk教授)
2009年10月:
東京大学先端科学技術研究センター 助教
2010年4月:
東京大学理学系研究科化学専攻 助教
2011年12月:
科学技術振興機構 さきがけ「細胞機能の構成的な理解と制御」研究員 兼任

連絡先

  • 東京大学大学院理学系研究科化学専攻生物有機化学研究室 化学西館2208号室
  • E-mail… y-goto@(@以下はchem.s.u-tokyo.ac.jp)
  • TEL…03-5841-4338
  • FAX…03-5841-8372

発表論文

"Highly selective inhibition of histone demethylases by de novo macrocyclic peptides."
A. Kawamura; M. Munzel; T. Kojima; C. Yapp; B. Bhushan; Y. Goto; A. Tumber; T. Katoh; O.N. King; T. Passioura; L.J. Walport; S.B. Hatch; S. Madden; S. Muller; P.E. Brennan; R. Chowdhury; R.J. Hopkinson; H. Suga; C.J. Schofield
Nature Communications, 8, 14773 (2017)
"Dissection of goadsporin biosynthesis by in vitro reconstitution leading to designer analogues expressed in vivo."
T. Ozaki; K. Yamashita; Y. Goto; M. Shimomura; S. Hayashi; S. Asamizu; Y. Sugai; H. Ikeda; H. Suga; H. Onaka
Nature Communications, 8, 14207 (2017)
"Characterization of the stereochemical configuration of lanthionines formed by the lanthipeptide synthetase GeoM."
N. Garg; Y. Goto; T. Chen; W.A. van der Donk
Biopolymers, 106, 834-842 (2016)
"Expanding the amino acid repertoire of ribosomal polypeptide synthesis via the artificial division of codon boxes."
Y. Iwane; A. Hitomi; H. Murakami; T. Katoh; Y. Goto; H. Suga
Nature chemistry, 8, 317-325 (2016)
"Ribosomal synthesis of peptides with multiple beta-amino acids."
T. Fujino; Y. Goto; H. Suga; H. Murakami
J. Am. Chem. Soc., 138, 1962-1969 (2016)
"Homologous trans-editing factors with broad tRNA specificity prevent mistranslation caused by serine/threonine misactivation."
Z. Liu; O. Vargas-Rodriguez; Y. Goto; E.M. Novoa; L. Ribas de Pouplana; H. Suga; K. Musier-Forsyth
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 112, 6027-6032 (2015)
"A Fluorescent Imaging Probe Based on a Macrocyclic Scaffold That Binds to Cellular EpCAM."
K. Iwasaki; Y. Goto; T. Katoh; T. Yamashita; S. Kaneko; H. Suga
Journal of molecular evolution, 81, 210-217 (2015)
"Recent developments of engineered translational machineries for the incorporation of non-canonical amino acids into polypeptides."
N. Terasaka; Y. Iwane; A.S. Geiermann; Y. Goto; H. Suga
International journal of molecular sciences, 16, 6513-6531 (2015)
"Ancestral AlaX editing enzymes for control of genetic code fidelity are not tRNA-specific."
E.M. Novoa; O. Vargas-Rodriguez; S. Lange; Y. Goto; H. Suga; K. Musier-Forsyth; L. Ribas de Pouplana
The Journal of biological chemistry, 290, 10495-10503 (2015)
"Selection-based discovery of macrocyclic peptides for the next generation therapeutics."
T. Morioka; N.D. Loik; C.J. Hipolito; Y. Goto; H. Suga
Current opinion in chemical biology, 26C, 34-41 (2015)
"Structural basis for potent inhibition of SIRT2 deacetylase by a macrocyclic peptide inducing dynamic structural change."
K. Yamagata; Y. Goto; H. Nishimasu; J. Morimoto; R. Ishitani; N. Dohmae; N. Takeda; R. Nagai; I. Komuro; H. Suga; O. Nureki
Structure, 22, 345-352 (2014)
"Selection-based discovery of druglike macrocyclic peptides."
T. Passioura; T. Katoh; Y. Goto; H. Suga
Annu. Rev. Biochem., 83, 727-752 (2014)
"One-pot synthesis of azoline-containing peptides in a cell-free translation system integrated with a posttranslational cyclodehydratase."
Y. Goto; Y. Ito; Y. Kato; S. Tsunoda; H. Suga
Chem. Biol., 21, 766-774 (2014)
"Investigating the role of a backbone to substrate hydrogen bond in OMP decarboxylase using a site-specific amide to ester substitution."
B.J. Desai; Y. Goto; A. Cembran; A.A. Fedorov; S.C. Almo; J. Gao; H. Suga; J.A. Gerlt
Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 111, 15066-15071 (2014)
"Distinct tRNA recognition strategies used by a homologous family of editing domains prevent mistranslation."
M. Das; O. Vargas-Rodriguez; Y. Goto; H. Suga; K. Musier-Forsyth
Nucleic Acids Res., 42, 3943-3953 (2014)
"Nonstandard peptide expression under the genetic code consisting of reprogrammed dual sense codons."
Y. Goto; M. Iseki; A. Hitomi; H. Murakami; H. Suga
ACS Chem. Biol., 8, 2630-2634 (2013)
"Reevaluation of the D-amino acid compatibility with the elongation event in translation."
T. Fujino; Y. Goto; H. Suga; H. Murakami
J. Am. Chem. Soc., 135, 1830-1837 (2013)
"Charging of tRNAs using ribozymes and selection of cyclic peptides containing thioethers."
P.C. Reid; Y. Goto; T. Katoh; H. Suga
Methods Mol. Biol., 805, 335-348 (2012)
"Selective thioether macrocyclization of peptides having the N-terminal 2-chloroacetyl group and competing two or three cysteine residues in translation."
K. Iwasaki; Y. Goto; T. Katoh; H. Suga
Org. Biomol. Chem., 10, 5783-5786 (2012)
"Flexizymes as a tRNA acylation tool facilitating genetic code reprogramming."
Y. Goto; H. Suga
Methods Mol. Biol., 848, 465-478 (2012)
"Lantibiotics from Geobacillus thermodenitrificans."
N. Garg; W. Tang; Y. Goto; S.K. Nair; W.A. van der Donk
Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 109, 5241-5246 (2012)
"Natural product-like macrocyclic N-methyl-peptide inhibitors against a ubiquitin ligase uncovered from a ribosome-expressed de novo library."
Y. Yamagishi; I. Shoji; S. Miyagawa; T. Kawakami; T. Katoh; Y. Goto; H. Suga
Chem. Biol., 18, 1562-1570 (2011)
"Ribosomal synthesis of backbone-macrocyclic peptides containing gamma-amino acids."
Y. Ohshiro; E. Nakajima; Y. Goto; S. Fuse; T. Takahashi; T. Doi; H. Suga
Chembiochem, 12, 1183-1187 (2011)
"Ribosomal synthesis of backbone macrocyclic peptides."
T. Katoh; Y. Goto; M.S. Reza; H. Suga
Chem. Commun., 47, 9946-9958 (2011)
"Mechanistic studies of Ser/Thr dehydration catalyzed by a member of the LanL lanthionine synthetase family."
Y. Goto; A. Okesli; W.A. van der Donk
Biochemistry, 50, 891-898 (2011)
"Preparation of materials for flexizyme reactions and genetic code reprogramming."
Y. Goto; T. Katoh; H. Suga
Protoc. Exchange, 779-790 (2011)
"Flexizymes for genetic code reprogramming."
Y. Goto; T. Katoh; H. Suga
Nat. Protoc., 6, 779-790 (2011)
"Ribosome evolution for two artificial amino acids in E. coli."
G. Hayashi; Y. Goto; H. Suga
Chem. Biol., 17, 320-321 (2010)
"Discovery of unique lanthionine synthetases reveals new mechanistic and evolutionary insights."
Y. Goto; B. Li; J. Claesen; Y. Shi; M.J. Bibb; W.A. van der Donk
PLoS Biol., 8, e1000339 (2010)
"Ribosomal synthesis of cyclic peptides with a fluorogenic oxidative coupling reaction."
Y. Yamagishi; H. Ashigai; Y. Goto; H. Murakami; H. Suga
Chembiochem, 10, 1469-1472 (2009)
"Ribosomal synthesis of peptides with C-terminal lactams, thiolactones, and alkylamides."
E. Nakajima; Y. Goto; Y. Sako; H. Murakami; H. Suga
Chembiochem, 10, 1186-1192 (2009)
"Translation initiation with initiator tRNA charged with exotic peptides."
Y. Goto; H. Suga
J. Am. Chem. Soc., 131, 5040-5041 (2009)
"Ribosomal synthesis of dehydrobutyrine- and methyllanthionine-containing peptides."
Y. Goto; K. Iwasaki; K. Torikai; H. Murakami; H. Suga
Chem. Commun., 3419-3421 (2009)
"Ribosomal synthesis of peptidase-resistant peptides closed by a nonreducible inter-side-chain bond."
Y. Sako; Y. Goto; H. Murakami; H. Suga
ACS Chem. Biol., 3, 241-249 (2008)
"Ligand-stabilized hairpin structures interfere with elongation of human telomere."
M. Hagihara; Y. Goto; K. Nakatani
Chembiochem, 9, 510-513 (2008)
"Reprogramming the translation initiation for the synthesis of physiologically stable cyclic peptides."
Y. Goto; A. Ohta; Y. Sako; Y. Yamagishi; H. Murakami; H. Suga
ACS Chem. Biol., 3, 120-129 (2008)
"Initiating translation with D-amino acids."
Y. Goto; H. Murakami; H. Suga
RNA, 14, 1390-1398 (2008)
"Analysis of mismatched DNA by mismatch binding ligand (MBL)-Sepharose affinity chromatography."
Y. Goto; H. Suda; A. Kobori; K. Nakatani
Anal. Bioanal. Chem., 388, 1165-1173 (2007)
"Small-molecule binding to the nonquadruplex form of the human telomeric sequence."
Y. Goto; S. Hagihara; M. Hagihara; K. Nakatani
Chembiochem, 8, 723-726 (2007)
"Evaluation of mismatch-binding ligands as inhibitors for Rev-RRE interaction."
K. Nakatani; S. Horie; Y. Goto; A. Kobori; S. Hagihara
Bioorg. Med. Chem., 14, 5384-5388 (2006)
"A new ligand binding to G-G mismatch having improved thermal and alkaline stability."
T. Peng; T. Murase; Y. Goto; A. Kobori; K. Nakatani
Bioorg. Med. Chem. Lett., 15, 259-262 (2005)
"Small-molecule ligand induces nucleotide flipping in (CAG)n trinucleotide repeats."
K. Nakatani; S. Hagihara; Y. Goto; A. Kobori; M. Hagihara; G. Hayashi; M. Kyo; M. Nomura; M. Mishima; C. Kojima
Nat. Chem. Biol., 1, 39-43 (2005)
"The binding of guanine-guanine mismatched DNA to naphthyridine dimer immobilized sensor surfaces: kinetic aspects."
K. Nakatani; A. Kobori; H. Kumasawa; Y. Goto; I. Saito
Bioorg. Med. Chem., 12, 3117-3123 (2004)
"Detection of guanine-adenine mismatches by surface plasmon resonance sensor carrying naphthyridine-azaquinolone hybrid on the surface."
S. Hagihara; H. Kumasawa; Y. Goto; G. Hayashi; A. Kobori; I. Saito; K. Nakatani
Nucleic Acids Res., 32, 278-286 (2004)

日本語総説・著書他

"特殊ペプチド創薬 ー第三の創薬シーズの可能性を拓くー"
山田光博; 梅本詩織; 後藤佑樹; 菅裕明
現代化学, 4月号, 38-41 (2016)
"人工特殊ペプチドの創製."
西尾洸祐; 石橋正成; 後藤佑樹; 菅裕明
進化分子工学の最前線, 71-100 (2014)
"人工生合成系による化合物生産〜複雑な化合物を簡単に作る〜 ."
後藤佑樹
生命化学研究レター, 46, 4-9 (2014)
"アゾリン骨格含有ペプチドの試験管内生合成〜擬天然物の簡便・自在合成を目指して ."
後藤佑樹
化学と工業, 67, 707-708 (2014)
"若手研究者からのメッセージ."
後藤佑樹
日本化学会バイオテクノロジー部会ニュースレター, 18, 11-13 (2014)
"In vitro synthetic biology of the genetic code: its development and applications."
H. Suga; C.J. Hipolito; Y. Goto; T. Katoh; N.K. Bashiruddin
Synthetic Biology, 1, 126-163 (2014)
"はじめての論文."
後藤佑樹
東京大学新聞, 2643, 3 (2013)
"コドンのランダム化による新規チオペプチド誘導体の探索."
後藤佑樹
ケミカルバイオロジー, (2013)
"日々是非日常."
後藤佑樹
日本RNA学会会報, 28, 21-22 (2013)
"翻訳系リモデリング."
後藤佑樹; 加藤敬行; 菅裕明
生命システム工学, 71-100 (2012)
"特殊ペプチド創薬の現在と展望."
伊藤悠美; 後藤佑樹; 菅裕明
最新ペプチド合成技術とその創薬研究への応用, 125-130 (2012)
"論文に見る最重要概念と革新実験データ."
後藤佑樹; 菅裕明
CSJカレントレビュー vol.6 核酸化学のニュートレンド, 32-35 (2011)
"ペプチド医薬品開発の新基盤技術「RaPIDシステム」."
下舞大; 後藤佑樹; 菅裕明
化学工業, 62, 109-115 (2011)
"RaPIDシステムが拓く新創薬戦略."
後藤佑樹; 伊東利紗; 菅裕明
MEDCHEM NEWS, 20, 26-31 (2010)
"イリノイ大学アーバナ・シャンペーン校留学体験記."
後藤佑樹
生命科学研究レター, 33, (2010)
"特殊ペプチドのコンビナトリアル翻訳合成."
後藤佑樹; 太田淳; 村上裕; 菅裕明
化学工業, 58, 255-262 (2007)

学会プロシーディング

Peptide Science誌、Nucleic Acids Research Symposium Series誌などに、計21件